L'armée de l'air a également "ciblé plusieurs foyers terroristes contenant des armes et des munitions", a fait savoir le porte-parole de l'armée égyptienne Tamer el-Refaï.
Selon des responsables égyptiens, les assaillants ont déclenché une explosion et ouvert le feu sur les fidèles au moment de la prière du vendredi.
Le président Abdel Fattah al-Sissi, qui a convoqué une réunion d'urgence de ses ministres chargés de la sécurité, a promis de répondre avec une "force brutale" après l'attaque.
"Les forces armées et la police vengeront nos martyrs et ramèneront la sécurité et la stabilité avec force très prochainement", a-t-il déclaré dans un discours.
Suite à cette attaque, la présidence égyptienne a déclaré trois jours de deuil national, d'après la télévision d'Etat.