Selon le quotidien Hurriyet, M. Erdogan a dû recevoir des soins médicaux après avoir eu "un bref malaise" lors de la grande prière à la mosquée Mimar Sinan.
Selon certains médias, il se serait brièvement évanoui dans la mosquée, mais ces informations n'ont pas été confirmées.
M. Erdogan a déclaré avoir souffert d'un problème de tension artérielle.
"Grâce à Dieu, je me suis rétabli rapidement. Je me sens bien maintenant et nous allons continuer notre programme", a-t-il déclaré, cité par l'agence gouvernementale Anadolu.
Le président turc a précisé qu'il assisterait dans l'après-midi à une cérémonie organisée par son parti, au pouvoir, pour marquer la fin du mois de jeûne du ramadan.
Musulman pieux, M. Erdogan avait eu un programme chargé pendant le mois de ramadan tout en respectant le jeûne, prononçant des discours presque chaque soir lors des repas de rupture du jeûne.
M. Erdogan, 63 ans, est au pouvoir depuis 2003, d'abord comme Premier ministre, puis depuis 2014 comme président. Cet ancien footballeur semi-professionnel tente de donner l'image d'un président fort et vigoureux.